磁振造影主要對於各種腫瘤及軟組織各種疾病之診斷，均能提供絕佳的對比影像。臨床上，磁振造影對實質器官如：腦神經系統、肌肉骨骼系統、脊椎軟骨、甲狀腺、肝、膽、脾、腎、胰、腎上腺、生殖器官 (膀胱、子宮、卵巢、輸精囊、攝護腺)及乳房，有絕佳的診斷價值。正子攝影可以提供全身掃描影像，主要是偵測惡性腫瘤及轉移，適用於頭頸部腫瘤、鼻咽癌、肺癌、乳癌、胰臟癌、大腸癌等。另外正子斷層掃描亦具有輻射線；而磁振造影則無。
